Υπολογιστική ανάλυση των λειτουργιών των μη κωδικών μεταγραφών στη γονιδιωματική ρύθμιση

Περίληψη

Οι ραγδαίες τεχνολογικές εξελίξεις την τελευταία δεκαετία επέτρεψαν αναλύσεις μεγάλης κλίμακας στο πεδίο του «ρυθμιστικού RNA», μετατρέποντας τα μη-κωδικά μετάγραφα, που αρχικά θεωρούνταν «σκουπίδια», σε ερευνητικό «χρυσωρυχείο». Τα μη-κωδικά μετάγραφα διαδραματίζουν καθοριστικό ρόλο σε ένα αξιοσημείωτο αριθμό από φυσιολογικές και παθολογικές βιολογικές διεργασίες. Η τεράστια παραγωγή δεδομένων ήταν επίσης ένας από τους σημαντικότερους παράγοντες της επιταχυνόμενης εξέλιξης του τομέα της βιοπληροφορικής, ενός τομέα εξειδικευμένου στην ανάλυση βιολογικών δεδομένων και την ανάπτυξη υπολογιστικών εργαλείων, απαραίτητων για την επεξεργασία και την ερμηνεία των αποτελεσμάτων τους. Αυτή η εργασία επικεντρώνεται στο λεπτομερή και ακριβή συνδυασμό υψηλής διεκπεραιωτικής ικανότητας δεδομένων και σύγχρονων τεχνικών μηχανικής μάθησης για την ανάπτυξη αλγορίθμων με στόχο το λειτουργικό χαρακτηρισμό των μη-κωδικών μεταγραφών.Η παρούσα διατριβή επικεντρώνεται σε μια συγκεκριμένη κατηγορία μεταγραφών ...
περισσότερα

Περίληψη σε άλλη γλώσσα

The emerging technological developments during the past decade enable large scale analyses in the “regulatory RNA” field and have turned non-coding RNA (ncRNA), initially considered as junk, into a research goldmine. ncRNAs play a crucial role in a remarkable variety of physiological and pathological biological processes. The vast production of data has also been the most important factor underlying the accelerated growth of bioinformatics, a field dedicated to the analysis of data and the development of computational tools indispensable for handling, manipulating and interpreting the results. This thesis focuses on the thorough aggregation of high-throughput data and state-of-the-art Machine Learning techniques in order to develop algorithms for the functional characterization of non-coding transcripts.The current dissertation is specialized on a specific category of RNA transcripts, the microRNAs. microRNAs (miRNAs) are small single stranded non-coding RNA molecules, ~22 nucleotides ...
περισσότερα
Πρέπει να είστε εγγεγραμένος χρήστης για έχετε πρόσβαση σε όλες τις υπηρεσίες του ΕΑΔΔ  Είσοδος /Εγγραφή

Όλα τα τεκμήρια στο ΕΑΔΔ προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα.

Διεύθυνση Handle
http://hdl.handle.net/10442/hedi/45135
ND
45135
Εναλλακτικός τίτλος
Computational analysis of non - coding RNA regulatory functions on a transcriptome - wide scale
Συγγραφέας
Καραγκούνη, Δήμητρα Ευστάθιος
Ημερομηνία
2019
Ίδρυμα
Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας. Σχολή Πολυτεχνική. Τμήμα Μηχανικών Ηλεκτρονικών Υπολογιστών, Τηλεπικοινωνιών και Δικτύων
Εξεταστική επιτροπή
Χατζηγεωργίου Άρτεμις
Μπάγκος Παντελεήμονας
Ποταμιάνος Γεράσιμος
Τσομπανοπούλου Παναγιώτα
Κατσαρός Δημήτριος
Χατζηιωάννου Αριστοτέλης
Παυλόπουλος Γεώργιος
Επιστημονικό πεδίο
Μηχανική & Τεχνολογία
Επιστήμες Ηλεκτρολόγου Μηχανικού, Ηλεκτρονικού Μηχανικού & Μηχανικού Η/Υ
Λέξεις-κλειδιά
MicroRNA; Πειράματα υψηλής απόδοσης; Πρόβλεψη στόχων; Πειραματικά επιβεβαιωμένοι στόχοι; Υπολογιστικά προβλεπόμενοι στόχοι; Μηχανική μάθηση
Χώρα
Ελλάδα
Γλώσσα
Ελληνικά
Άλλα στοιχεία
153 σ., εικ., σχημ., γραφ.