Αρχική
Πλοήγηση
Επιστημονικό πεδίο
Ημερομηνία
Συγγραφέας
Χώρα
Γλώσσα
Ίδρυμα
Σχετικά με το ΕΑΔΔ
Κατάθεση Διατριβής
Συχνές Ερωτήσεις
Κέντρο Υποστήριξης Χρηστών
Επικοινωνία
Ανοικτά Δεδομένα
Είσοδος
Εγγραφή
Ξέχασα τον κωδικό
A-
A0
A+
|
EN
Βιοπληροφορική ανάλυση δεδομένων πειραμάτων γονιδιακής έκφρασης
Αρχική
Πλοήγηση
Επιστημονικό πεδίο
Ημερομηνία
Συγγραφέας
Χώρα
Γλώσσα
Ίδρυμα
Σχετικά με το ΕΑΔΔ
Κατάθεση Διατριβής
Συχνές Ερωτήσεις
Κέντρο Υποστήριξης Χρηστών
Επικοινωνία
Ανοικτά Δεδομένα
Είσοδος
Εγγραφή
Ξέχασα τον κωδικό
A-
A0
A+
|
EN
Βιοπληροφορική ανάλυση δεδομένων πειραμάτων γονιδιακής έκφρασης
Περίληψη
Στόχος της παρούσας διατριβής ήταν η επίτευξη μίας πλατφόρμας επιτυχούς ανάλυσης δεδομένων πειραμάτων μικροσυστοιχιών. Η διαδικασία αναλύεται από το στάδιο της εισαγωγής των δεδομένων εντάσεων και συνεχίζεται στην
Ημερομηνία
Συγγραφέας
Χώρα
Γλώσσα
Ίδρυμα
Σχετικά με το ΕΑΔΔ
Κατάθεση Διατριβής
Συχνές Ερωτήσεις
Κέντρο Υποστήριξης Χρηστών
Επικοινωνία
Ανοικτά Δεδομένα
Είσοδος
Εγγραφή
Ξέχασα τον κωδικό
A-
A0
A+
|
EN
Βιοπληροφορική ανάλυση δεδομένων πειραμάτων γονιδιακής έκφρασης
Περίληψη
Στόχος της παρούσας διατριβής ήταν η επίτευξη μίας πλατφόρμας επιτυχούς ανάλυσης δεδομένων πειραμάτων μικροσυστοιχιών. Η διαδικασία αναλύεται από το στάδιο της εισαγωγής των δεδομένων εντάσεων και συνεχίζεται στην
Βιοπληροφορική ανάλυση δεδομένων πειραμάτων γονιδιακής έκφρασης
Περίληψη
Στόχος της παρούσας διατριβής ήταν η επίτευξη μίας πλατφόρμας επιτυχούς ανάλυσης δεδομένων πειραμάτων μικροσυστοιχιών. Η διαδικασία αναλύεται από το στάδιο της εισαγωγής των δεδομένων εντάσεων και συνεχίζεται στην εύρεση στατιστικά σημαντικών γονιδίων. Ακολουθεί η εξόρυξη βιολογικών δεδομένων, ώστε να καταστεί δυνατή η αντίληψη των λειτουργικών συσχετίσεων μεταξύ των στατιστικά σημαντικών γονιδίων και καταλήγει στην επεξήγηση των τρόπων meta-analysis των πειραμάτων ή των αποτελεσμάτων πειραμάτων μικροσυστοιχιών. Η σημαντικότητα της εργασίας ενισχύεται με δύο ακόμα τρόπους: Α. Παρουσιάζεται η χαρτογράφηση όλων των διαθέσιμων διαδικτυακών ή μη, προγραμμάτων, τα οποία διευκολύνουν την διεκπεραίωση όλων των σημαντικών σταδίων μιας ολοκληρωμένης ανάλυσης. Πρέπει να τονιστεί ότι έμφαση δίνεται ιδιαίτερα σε εκείνα της κατηγορίας ελεύθερου λογισμικού. Β. Παρουσιάζονται τέσσερα διαφορετικά πειράματα στα οποία χρησιμοποιήθηκε επιτυχώς η διαδικασία ανάλυσης και τα αποτελέσματά τους έχουν ήδη δημο ...
Δηλώνω ότι έλαβα γνώση και ανεπιφύλακτα συμφωνώ και αποδέχομαι τους Στόχος της παρούσας διατριβής ήταν η επίτευξη μίας πλατφόρμας επιτυχούς ανάλυσης δεδομένων πειραμάτων μικροσυστοιχιών. Η διαδικασία αναλύεται από το στάδιο της εισαγωγής των δεδομένων εντάσεων και συνεχίζεται στην εύρεση στατιστικά σημαντικών γονιδίων. Ακολουθεί η εξόρυξη βιολογικών δεδομένων, ώστε να καταστεί δυνατή η αντίληψη των λειτουργικών συσχετίσεων μεταξύ των στατιστικά σημαντικών γονιδίων και καταλήγει στην επεξήγηση των τρόπων meta-analysis των πειραμάτων ή των αποτελεσμάτων πειραμάτων μικροσυστοιχιών. Η σημαντικότητα της εργασίας ενισχύεται με δύο ακόμα τρόπους: Α. Παρουσιάζεται η χαρτογράφηση όλων των διαθέσιμων διαδικτυακών ή μη, προγραμμάτων, τα οποία διευκολύνουν την διεκπεραίωση όλων των σημαντικών σταδίων μιας ολοκληρωμένης ανάλυσης. Πρέπει να τονιστεί ότι έμφαση δίνεται ιδιαίτερα σε εκείνα της κατηγορίας ελεύθερου λογισμικού. Β. Παρουσιάζονται τέσσερα διαφορετικά πειράματα στα οποία χρησιμοποιήθηκε επιτυχώς η διαδικασία ανάλυσης και τα αποτελέσματά τους έχουν ήδη δημοσιευτεί είτε βρίσκονται υπό δημοσίευση. Έτσι αποδεικνύεται η χρηστικότητα της διαδικασίας ανάλυσης σε πραγματικά πειραματικά δεδομένα. Η διατριβή ολοκληρώνεται με την προβολή μεθόδων για την επίτευξη ακριβέστερων μετρήσεων γονιδιακής έκφρασης και αναφέρεται η συμβολή της τεχνολογίας μικροσυστοιχιών γονιδιακής έκφρασης στην βιοϊατρική έρευνα και στην εξατομικευμένη ιατρική
περισσότερα
Περίληψη σε άλλη γλώσσα
Όρους Χρήσης
του Εθνικού Αρχείου Διδακτορικών Διατριβών, καθώς και της
45
The aim of this thesis was to conceive and produce a platform for the successful data analysis of microarray experiments. The process is analyzed from the point of intensity data import and continues to the finding of statistically significant genes called differentially expressed genes or DEGs. The presentation of methods for the extraction of biological data follows. These techniques enable the understanding of functional relationships between the statistically significant genes. The presentation of the pipeline for the microarray data analysis concludes by explaining how to conduct meta-analysis of raw microarray experimental data or experimental results. The significance of the work is strengthened by two other ways: A. By the presentation of the mapping of all available online or not, programs that facilitate the handling of all important stages of a comprehensive analysis. It should be noted that particular emphasis is given to the free software. B. By the presentation of four different experiments on which the analysis procedure has been successfully used and results have been published or are about to be publicized. This shows the viability and usefulness of the analysis process in real experimental data. The thesis concludes with the screening methods used to obtain precise measurements of gene expression and indicate the contribution of gene expression microarray technology in biomedical research and personalized medicine
Κατέβασμα αρχείου PDF
περισσότερα
Όλα τα τεκμήρια στο ΕΑΔΔ προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα.
Διαβάστε τη διατριβή (Online)
Κατεβάστε τη διατριβή σε μορφή PDF (2.08 MB)
(Η υπηρεσία είναι διαθέσιμη μετά από δωρεάν
εγγραφή
)
Δηλώνω ότι έλαβα γνώση και ανεπιφύλακτα συμφωνώ και αποδέχομαι τους
Όρους Χρήσης
του Εθνικού Αρχείου Διδακτορικών Διατριβών, καθώς και της
Κατέβασμα αρχείου PDF
Όλα τα τεκμήρια στο ΕΑΔΔ προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα.
DOI
10.12681/eadd/21916
Διεύθυνση Handle
http://hdl.handle.net/10442/hedi/21916
ND
21916
Εναλλακτικός τίτλος
Bioinformatics data analysis of gene expressdion related experiments
Συγγραφέας
Παπαρούντας, Τριαντάφυλλος (Πατρώνυμο: Λουκάς)
Ημερομηνία
2009
Ίδρυμα
Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο (ΕΜΠ)
. Σχολή Χημικών Μηχανικών. Τομέας IV
Εξεταστική επιτροπή
Κολίσης Φραγκίσκος
Μπουντουβής Ανδρέας
Κουτσιλιέρης Μιχάλης
Νικήτα Κωνσταντίνα
Αϊδίνης Βασίλης
Κέκος Δημήτριος
Χριστακόπουλος Παύλος
Επιστημονικό πεδίο
Φυσικές Επιστήμες
➨
Επιστήμη Ηλεκτρονικών Υπολογιστών και Πληροφορική
Λέξεις-κλειδιά
Βιοπληροφορική; Μικροσυστοιχίες DNA; Εξόρυξη βιολογικών δεδομένων; Μετα-ανάλυση; Συσχετιστική ανάλυση; Πειράματα μικροσυστοιχιών; Μέθοδος ανάλυσης μικροσυστοιχιών
Χώρα
Ελλάδα
Γλώσσα
Ελληνικά
Άλλα στοιχεία
184 σ., ευρ.
Στατιστικά χρήσης
ΠΡΟΒΟΛΕΣ
Αφορά στις μοναδικές επισκέψεις της διδακτορικής διατριβής για την χρονική περίοδο 07/2018 - 07/2023.
Πηγή:
Google Analytics
.
ΞΕΦΥΛΛΙΣΜΑΤΑ
Αφορά στο άνοιγμα του online αναγνώστη για την χρονική περίοδο 07/2018 - 07/2023.
Πηγή:
Google Analytics
.
ΜΕΤΑΦΟΡΤΩΣΕΙΣ
Αφορά στο σύνολο των μεταφορτώσων του αρχείου της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή:
Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών
.
ΧΡΗΣΤΕΣ
Αφορά στους συνδεδεμένους στο σύστημα χρήστες οι οποίοι έχουν αλληλεπιδράσει με τη διδακτορική διατριβή. Ως επί το πλείστον, αφορά τις μεταφορτώσεις.
Πηγή:
Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών
.
Σχετικές εγγραφές
(με βάση τις επισκέψεις των χρηστών)
Προηγμένες τεχνικές εξόρυξης δεδομένων και γνώσης σε βάσεις βιολογικών δεδομένων
Παράλληλοι αλγόριθμοι εξόρυξης και ανάλυσης δεδομένων σε πλέγματα υπολογιστών με εφαρμογές στη βιοπληροφορική
Ανάπτυξη μεθοδολογιών βιοπληροφορικής για τη μελέτη βιολογικών συστημάτων μεγάλης πολυπλοκότητας
Επεξεργασία και ανάλυση βιολογικών δεδομένων με τη χρήση ευφυών υπολογιστικών μεθόδων
Ανάλυση, σχεδιασμός και υλοποίηση αλγορίθμων υπολογιστικής νοημοσύνης στη βιοϊατρική και τη βιοπληροφορική
Ανάπτυξη ενοποιημένων τεχνικών διαχείρισης και επεξεργασίας βιολογικών δεδομένων με εφαρμογές στη μελέτη της γονιδιακής έκφρασης
Ανακάλυψη γνώσης από βιολογικά δεδομένα
Προσδιορισμός και χαρακτηρισμός σημειοχημικών ουσιών του Drosophila suzukii για την ανάπτυξη ολοκληρωμένης στρατηγικής διαχείρισής του στην Ελλάδα
Μέθοδοι βιοπληροφορικής, υπολογιστικής συστημικής βιολογίας και μηχανικής μάθησης, εφαρμοσμένες στην in silico ογκολογία
Statistical methodology for the analysis of genomic data
"Βιοπληροφορική ανάλυση δεδομένων πειραμάτων γονιδιακής έκφρασης"
Πληκτρολογήστε το κείμενο της εικόνας!
Δηλώνω ότι έλαβα γνώση και ανεπιφύλακτα συμφωνώ και αποδέχομαι τους
Όρους Χρήσης
του Εθνικού Αρχείου Διδακτορικών Διατριβών, καθώς και της .
λιγότερα
περισσότερα