Μελέτη ελληνικών φυλών του ιού του μωσαϊκού της αγγουριάς: Cucumber mosaic virus, CMV

Abstract

The biodiversity of cucumber mosaic virus (CMV) has been thoroughly investigated but some information, as the phylogenetic relationship among its isolates or natural population is still missing. So the application of different techniques for isolates differentiation and characterization on a wide range of isolates in combination with dendrogrms from bibliographic data can provide useful information for research, diagnosisi, plant breeding and epidemology. Here we established the most appropriate fuidelines for detecting and typing CMV isolates according to the new phylogenetic relationship, which is I_a, I_b, II. The same study we have done with CMV satellites. The conclusions obtained from the above work were used for typing national CMV and satellite populations on field surveys in Southern Greece. The results of this survey, we used to make secisions to the selection of propper "vacines' for the bioconrol of CMV epidemics in Greece. The results were promising for commercialization of this biocontrol technology in Greece. The last part of our study targeted to the genetic microeterogeneaty of CMV isolates that means differences in one or a few nucleotides in relation to their biological properties. The results showed that a single nucleotide change in the CMV genome (CP) may affect. the bilogical exression of an isolate dramatically. The criteria by which someone could detect this kind of biodiversity are discussed.

Η βιοπαραλλακτικότητα του ιού του μωσαϊκού της αγγουριάς (Cucumber mosaic virus, CMV) έχει μελετηθεί εκτενώς τα προηγούμενα χρόνια. Ωστόσο τα νέα δεδομένα καθώς και η εξέλιξη των τεχνικών δείχνουν οτι ακόμα υπάρχουν κενά. Στην εργασία αυτή ορίζουμε μια κατευθυντήρια γραμμή για την μελέτη της βιοπαραλλακτικότητας των απομονώσεων του ιού χρησιμοποιώντας κατάλληλες τεχνικές και δενδρογράμματα. Ετχι ορίστηκε σαφώς η νέα φυλογεννετική σχέση των απομονώσεων του ιού Ι_α,Ι_β, ΙΙ καθώς και οι τεχνκές με τις οποίες μπορούμε να ομαδοποιήσουμε ως προς αυτή τις απομονώσεις του ιού. Τα συμπεράσματα από αυτή την εργασία χρησιμοποιήθηκαν για να ομαδοποιηθουν οι φυσικοί πληθυσμοί του ιού κατά την διάρκεια μιας επισκοπήσεως αγρών στην Νότιο Ελλάδα. Παρόμοια κινηθήκαμε για να ομαδοποιήσουμε τις παραλλαγές του δορυφόρου του ιού. Ακολούθως τα δεδομένα από αυτή την επισκόπηση χρησιμοποιήθηκαν για να επιλέξουμε το εμβόλιο με τα καταλληλότερα χαρακτηριστικά το οποίο θα εξασφάλιζε την καλύτερη απατελεσματικότητα για την καταπολέμηση των νόσων που προκαλούνται από τον ιό με την μέθοδο του προεμβολιασμού. Τα αποτελέσματα από την εφαρμογή της μεθόδου κρίθηκαν ικανοποιητικά ακκόμα και για την εμπορευματοποίηση αυτή. Στο τελευταίο κεφάλαιο μελετάται η μικροετερογένεια του γενώματος του ιού η οποία οφεόλεται σε μια ή λίγες αλλαγές βάσεων σε συσχέτιση με τις βιολογικές ιδιότητες του ιού. Τα αποτελέσματα έδειξαν οτι μιά αλλαγή νουκλεοτιδίου στο γόνο της καψιδιακής πρωτείνης μπορεί να επηρεάσει δραματικά την βιολογική έκφραση μιας απομονώσεως. Εξετάστηκαν τα κριτήρια με τα οποία κάποιος μπορεί να ανιχνεύσει τέτοιες μικροδιαφορές βιοπαραλλακτικότητας.