Μοριακή εξέλιξη ιών του ανθρώπου και εφαρμογές στη μοριακή επιδημιολογία

Περίληψη

Η παρούσα διδακτορική διατριβή έχει ως σκοπό την εφαρμογή μεθόδων φυλογενετικής συμπερασματολογίας σε μοριακά δεδομένα ιών που προσβάλλουν τον άνθρωπο με σκοπό την εξαγωγή επιδημιολογικών συμπερασμάτων. Στα πλαίσια της διατριβής μελετήθηκαν τρεις ιοί, ο ιός της ανθρώπινης ανοσοανεπάρκειας (HIV), ο κοροναϊός του οξέως αναπνευστικού συνδρόμου (SARS-CoV) και o ιός της Ηπατίτιδας C (HCV). Στον ιό της ανθρώπινης ανοσοανεπάρκειας μελετήθηκε ο ανασυνδυασμός και η φυλογενετική πληροφορία. Πιο συγκεκριμένα βρέθηκε ότι ο ανασυνδυασμός δε συμβαίνει τυχαία κατά μήκους του γονιδιώματος του HIV και ότι σχετίζεται με τη γενετική ομοιότητα. Επίσης βρέθηκε ότι: α) η φυλογενετική πληροφορία δεν κατανέμεται ομοιόμορφα κατά μήκους του γονιδιώματος, β) ο ανασυνδυασμός εκφυλίζει τη φυλογενετική πληροφορία και γ) ότι η φυλογενετική πληροφορία σχετίζεται με τη γενετική ομοιότητα. Στον ιό του οξέως αναπνευστικού συνδρόμου μελετήθηκε η ταξινόμησή του και ελέγχθηκε το σενάριο του ανασυνδυασμού. Συγκεκριμένα βρέθ ...
περισσότερα

Περίληψη σε άλλη γλώσσα

The purpose of this PhD thesis was the application of phylogenetic methodology on virus’ molecular data in order to make epidemiological inferences. For this reason three viruses were studied, the Human Immunodeficiency Virus (HIV), the Severe Acute Respiratory Syndrome CoronaVirus (SARS-CoV) and the Hepatitis C Virus (HCV). For HIV we studied the distribution of recombination frequency and the distribution of phylogenetic information. More specifically we found that recombination was not randomly distributed across the genome and more specifically it was associated with genetic similarity. Moreover we found that: a) the phylogenetic information is not uniformly distributed across the genome, b) recombination disrupts the phylogenetic information content and c) there is a relationship between phylogenetic information and genetic similarity. For SARS-CoV we studied the taxonomy and we tested for the scenario of recombinant origin. More specifically we found that the virus was phylogenet ...
περισσότερα

Όλα τα τεκμήρια στο ΕΑΔΔ προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα.

DOI
10.12681/eadd/23973
Διεύθυνση Handle
http://hdl.handle.net/10442/hedi/23973
ND
23973
Εναλλακτικός τίτλος
Molecular evolution of human viruses and application in molecular epidemiology
Συγγραφέας
Μαγιορκίνης, Γκίκας (Πατρώνυμο: Νικόλαος)
Ημερομηνία
2009
Ίδρυμα
Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών (ΕΚΠΑ). Σχολή Επιστημών Υγείας. Τμήμα Ιατρικής. Τομέας Κονωνικής Ιατρικής - Ψυχιατρικής και Νευρολογίας. Εργαστήριο Υγιεινής και Επιδημιολογίας
Εξεταστική επιτροπή
Χατζάκης Άγγελος
Καλαποθάκη Βικτώρια
Ζαβιτσάνος Ξενοφών
Κατσουγιάννη Κλέα
Λάγιου Παγώνα
Κουμαντάκη Υβόνη
Τσακρής Αθανάσιος
Επιστημονικό πεδίο
Ιατρική και Επιστήμες Υγείας
Ιατρική Βιοτεχνολογία
Λέξεις-κλειδιά
Φυλογενετική; Επιδημιολογία; Μοριακή εξέλιξη; Ιοί
Χώρα
Ελλάδα
Γλώσσα
Ελληνικά
Άλλα στοιχεία
232 σ., εικ.
Στατιστικά χρήσης
ΠΡΟΒΟΛΕΣ
Αφορά στις μοναδικές επισκέψεις της διδακτορικής διατριβής για την χρονική περίοδο 07/2018 - 07/2023.
Πηγή: Google Analytics.
ΞΕΦΥΛΛΙΣΜΑΤΑ
Αφορά στο άνοιγμα του online αναγνώστη για την χρονική περίοδο 07/2018 - 07/2023.
Πηγή: Google Analytics.
ΜΕΤΑΦΟΡΤΩΣΕΙΣ
Αφορά στο σύνολο των μεταφορτώσων του αρχείου της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
ΧΡΗΣΤΕΣ
Αφορά στους συνδεδεμένους στο σύστημα χρήστες οι οποίοι έχουν αλληλεπιδράσει με τη διδακτορική διατριβή. Ως επί το πλείστον, αφορά τις μεταφορτώσεις.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
Σχετικές εγγραφές (με βάση τις επισκέψεις των χρηστών)