Βιοπληροφορική ανάλυση, διαχείριση και οργάνωση βιολογικών δεδομένων σχετιζόμενων με τη μετα-μεταφραστική ρύθμιση
Περίληψη
Η μετα-μεταφραστική ρύθμιση αποτελεί ένα σημαντικό, γρήγορο και ενεργειακά αποδοτικό επίπεδο της κυτταρικής ρύθμισης, για το οποίο έχουν αναπτυχθεί πολλές ομικές τεχνολογίες μεγάλης κλίμακας. Η μετα-μεταφραστική τροποποίηση των αμινοξέων και ειδικότερα η πρωτεϊνική φωσφορυλίωση και μεθυλίωση έχουν κεντρικό ρόλο. Αυτή η διδακτορική διατριβή εστίασε σε δημοσιευμένα δεδομένα φωσφο-πρωτεωμικής και μεθυλ-πρωτεωμικής με σκοπό να αναπτύξει υπολογιστικά εργαλεία και βιοπληροφορικές μεθόδους/αναλύσεις που θα μπορούν να τα αναλύσουν και να εξάγουν γνώση για τις ιδιότητες αυτού του επιπέδου ρύθμισης. Κατά την διάρκεια αυτής της διατριβής, συλλέχθησαν, φιλτραρίστηκαν, αποθηκεύτηκαν και οργανώθηκαν δημοσιευμένα δεδομένα, με τη βοήθεια ενός υπολογιστικού εργαλείου διαχείρισης της Βιβλιογραφίας και μιας βάσης δεδομένων που ανέπτυξα. Επιπλέον, και άλλα ομικά και εξελικτικά δεδομένα ενσωματώθη
Βιοπληροφορική ανάλυση, διαχείριση και οργάνωση βιολογικών δεδομένων σχετιζόμενων με τη μετα-μεταφραστική ρύθμιση
Περίληψη
Η μετα-μεταφραστική ρύθμιση αποτελεί ένα σημαντικό, γρήγορο και ενεργειακά αποδοτικό επίπεδο της κυτταρικής ρύθμισης, για το οποίο έχουν αναπτυχθεί πολλές ομικές τεχνολογίες μεγάλης κλίμακας. Η μετα-μεταφραστική τροποποίηση των αμινοξέων και ειδικότερα η πρωτεϊνική φωσφορυλίωση και μεθυλίωση έχουν κεντρικό ρόλο. Αυτή η διδακτορική διατριβή εστίασε σε δημοσιευμένα δεδομένα φωσφο-πρωτεωμικής και μεθυλ-πρωτεωμικής με σκοπό να αναπτύξει υπολογιστικά εργαλεία και βιοπληροφορικές μεθόδους/αναλύσεις που θα μπορούν να τα αναλύσουν και να εξάγουν γνώση για τις ιδιότητες αυτού του επιπέδου ρύθμισης. Κατά την διάρκεια αυτής της διατριβής, συλλέχθησαν, φιλτραρίστηκαν, αποθηκεύτηκαν και οργανώθηκαν δημοσιευμένα δεδομένα, με τη βοήθεια ενός υπολογιστικού εργαλείου διαχείρισης της Βιβλιογραφίας και μιας βάσης δεδομένων που ανέπτυξα. Επιπλέον, και άλλα ομικά και εξελικτικά δεδομένα ενσωματώθηr>



Κατεβάστε τη διατριβή σε μορφή PDF (19.14 MB)
-->
Βιοπληροφορική ανάλυση, διαχείριση και οργάνωση βιολογικών δεδομένων σχετιζόμενων με τη μετα-μεταφραστική ρύθμιση
Περίληψη
Η μετα-μεταφραστική ρύθμιση αποτελεί ένα σημαντικό, γρήγορο και ενεργειακά αποδοτικό επίπεδο της κυτταρικής ρύθμισης, για το οποίο έχουν αναπτυχθεί πολλές ομικές τεχνολογίες μd">
περισσότερα
Περίληψη σε άλλη γλώσσα
Post-translational regulation is an important, fast and energy efficient level of gene regulation that has attracted the focus of many high-throughput technologies in the last 20 years. Post-translational modifications of amino acids and especially proteinphosphorylation play a pivotal role at this level of cellular regulation. Accordingly, this thesis focused on publicly available and abundant high-throughput proteinphosphorylation and methylation data, in order to develop computational tools and bioinformatics methods and pipelines, with the aim to analyze them and transform raw data into biological knowledge, about the properties of the eukaryotic phosphoproteome. During this thesis, phosphoproteomic and methylproteomic data were mined from the literature. An annotation tool and a database were developed in order to facilitate the mining and storage of these complex data, that were integrated with many other omic and evolutionary data. Statistical analyses of the gathered and filter ...
περισσότερα
![]() |
Όλα τα τεκμήρια στο ΕΑΔΔ προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα. | ||||||
Εναλλακτικός τίτλος | Bioinformatics analysis, management and organization of biological data related to post-translational regulation | |||||
Συγγραφέας | Βλασταρίδης, Παναγιώτης (Πατρώνυμο: Νικόλαος) | |||||
Ημερομηνία | 2020 | |||||
Ίδρυμα | Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας. Σχολή Επιστημών Υγείας. Τμήμα Βιοχημείας και Βιοτεχνολογίας. Εργαστήριο Βιοπληροφορικής | |||||
Εξεταστική επιτροπή | Αμούτζιας Γρηγόριος Oliver Stephen Van de Peer Yves Μόσιαλος Δημήτριος Σίμος Γεώργιος Στρατίκος Ευστράτιος Παπακυριακού Αθανάσιος | |||||
Επιστημονικό πεδίο | Φυσικές Επιστήμες Επιστήμη Ηλεκτρονικών Υπολογιστών και Πληροφορική Βιολογία Επιστήμες Μηχανικού και Τεχνολογία Επιστήμη Ηλεκτρολόγου Μηχανικού, Ηλεκτρονικού Μηχανικού, Μηχανικού Η/Υ Ιατρική και Επιστήμες Υγείας Ιατρική Βιοτεχνολογία | |||||
Λέξεις-κλειδιά | Βιοπληροφορική; Εξέλιξη; Μετα-μεταφραστική ρύθμιση; Πρωτεϊνική φωσφορυλίωση; Πρωτεϊνική μεθυλίωση; Βάσεις δεδομένων; Νευρωνικά δίκτυα; Πρόβλεψη | |||||
Χώρα | Ελλάδα | |||||
Γλώσσα | Αγγλικά | |||||
Άλλα στοιχεία | 147 σ., εικ., πιν., σχημ., γραφ. |
Στατιστικά χρήσης

ΠΡΟΒΟΛΕΣ
Αφορά στις μοναδικές επισκέψεις της διδακτορικής διατριβής για την χρονική περίοδο 07/2018 - 07/2023.
Πηγή: Google Analytics.
Πηγή: Google Analytics.

ΞΕΦΥΛΛΙΣΜΑΤΑ
Αφορά στο άνοιγμα του online αναγνώστη για την χρονική περίοδο 07/2018 - 07/2023.
Πηγή: Google Analytics.
Πηγή: Google Analytics.

ΜΕΤΑΦΟΡΤΩΣΕΙΣ
Αφορά στο σύνολο των μεταφορτώσων του αρχείου της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.

ΧΡΗΣΤΕΣ
Αφορά στους συνδεδεμένους στο σύστημα χρήστες οι οποίοι έχουν αλληλεπιδράσει με τη διδακτορική διατριβή. Ως επί το πλείστον, αφορά τις μεταφορτώσεις.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.