Ιός του Δυτικού Νείλου: μελέτη των εξελικτικών σχέσεων στελεχών του ιού στην Ελλάδα, αξιολόγηση διασταυρούμενης προστασίας εμβολίου σε ίππους και ανάπτυξη μοριακών και ορολογικών διαγνωστικών δοκιμών

Περίληψη

Σκοπός της διδακτορικής διατριβής ήταν η μελέτη των εξελικτικών σχέσεων και της φυλογεωγραφίας των στελεχών του ιού του Δυτικού Νείλου που ανήκουν στον εξελικτικό κλάδο 2 και κυκλοφορούν στην Ελλάδα από το 2010. Επιπλέον, για πρώτη φορά παγκοσμίως αξιολογήθηκαν μέσα πρόληψης και διάγνωσης της λοίμωξης από στελέχη του εξελικτικού κλάδου 2 σε ίππους. Εξετάσθηκε μεγάλος αριθμός βιολογικών υλικών από ζώα και κουνούπια, τα οποία προσκομίστηκαν στο εργαστήριό μας ή συλλέχθηκαν στο πλαίσιο ερευνητικών προγραμμάτων αξιολόγησης συστημάτων επιτήρησης του ιού, κατά τα έτη 2010-2018. Για τις ανάγκες του εργαστηριακού ελέγχου, αναπτύχθηκε πρωτόκολλο real-time RT-PCR για την ειδική ανίχνευση των στελεχών του εξελικτικού κλάδου 2. Αναπτύχθηκε, επίσης, ένα νέο πρωτόκολλο αλληλούχησης επόμενης γενιάς (NGS) που βασίζεται σε ένθετες PCR. Η μέθοδος αυτή χρησιμοποιήθηκε για τον προσδιορισμό του πλήρους γονιδιώματος 9 ιικών στελεχών. Στη συνέχεια, χρησιμοποιήθηκαν λογισμικά βιοπληροφορικής για τη μελέτη της ...
περισσότερα

Περίληψη σε άλλη γλώσσα

In the framework of the present doctoral thesis, a comprehensive study of evolutionary and phylogenetic relationships of lineage 2 West Nile virus (WNV) strains, which circulate in Greece since 2010 was carried out. Additionally, for the first time, preventive and diagnostic methods regarding lineage 2 WNV infections in horses were evaluated. A large number of biological specimens originating from animals and mosquitoes were tested. These specimens were submitted to our laboratory or were collected within the framework of research projects between 2010 and 2018. A real-time RT-PCR method, for the specific detection of lineage 2 WNV genome, was developed and subsequently applied for the virological screening of the samples. The full genome of 9 detected strains was determined by applying next generation sequencing (NGS). For this purpose, an enrichment strategy based on nested PCRs was developed. Subsequently, bioinformatics was employed for the study of the phylogeography of the Europe ...
περισσότερα
Η διατριβή είναι δεσμευμένη από τον συγγραφέα  (μέχρι και: 3/2022)
Το πλήρες κείμενο της διατριβής είναι διαθέσιμο σε έντυπη μορφή από τη Βιβλιοθήκη Επιστήμης και Τεχνολογίας του ΕΚΤ
Διεύθυνση Handle
http://hdl.handle.net/10442/hedi/45389
ND
45389
Εναλλακτικός τίτλος
West Nile virus: study of the evolutionary relationships of virus strains in Greece, evaluation of the cross-protection offered in horses by a vaccine and development of molecular and serological diagnostic assays
Συγγραφέας
Χαϊντούτης, Σεραφείμ Χρήστος
Ημερομηνία
2019
Ίδρυμα
Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης (ΑΠΘ). Σχολή Επιστημών Υγείας. Τμήμα Κτηνιατρικής. Τομέας Κλινικών. Εργαστήριο Διαγνωστικό
Εξεταστική επιτροπή
Δόβας Χρυσόστομος
Μπιλλίνης Χαράλαμπος
Διακάκης Νικόλαος
Παπά-Κονιδάρη Άννα
Πολυζοπούλου Ζωή
Αμούτζιας Γρηγόριος
Βαλιάκος Γεώργιος
Επιστημονικό πεδίο
Ιατρική & Επιστήμες Υγείας
Άλλες Ιατρικές Επιστήμες
Γεωργικές Επιστήμες
Κτηνιατρική
Λέξεις-κλειδιά
Ιός του Δυτικού Νείλου; Φυλογεωγραφία; Εξέλιξη των ιών; Διασταυρούμενη ανοσία; Αδρανοποιημένο εμβόλιο; Κτηνιατρική μικροβιολογία; Ανοσολογία; Κλινική βιοχημεία; Μοριακή ιολογία; Λοιμώδη νοσήματα
Χώρα
Ελλάδα
Γλώσσα
Ελληνικά
Άλλα στοιχεία
xiv 172 σ., εικ., πιν., χαρτ., σχημ., γραφ.