Μικροβίωμα και ιδιοπαθή φλεγμονώδη νοσήματα εντέρου

Abstract

The gut microbiota is believed to play a central role in the development of the inflammatory bowel diseases (IBD); Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC). Recently, it has been suggested that live commensal intestinal bacteria are present in the adipose tissue and the peripheral blood where they can induce inflammation. Since this process can trigger inflammation the aim of the present study was to evaluate the intestinal bacteria composition and translocation of bacteria in IBD. Both blood and tissue biopsy samples were collected from adult patients with active CD (n=6), inactive CD (n=6), active UC (n=14), and inactive UC (n=6) as well as form healthy individuals (n=20) that underwent screening colonoscopy. Most of the patients were newly diagnosed and none of them received antibiotics. All of the adults received 5-ASA (± Azathioprine ± Cortisone) or Azathioprine. Using a sensitive reverse transcription–quantitative real-time PCR (RT-qPCR) method, we determined the composition of microbiota. NOD2/CARD15 genotyping, was also studied. Total bacterial DNA concentration was increased in tissue and blood samples of CD and UC patients compared to healthy controls (p<0.05). Furthermore, the active IBD cases had higher total bacterial DNA concentration levels compared to the inactive cases (p<0.05). Three species characterized dysbiosis in IBD, namely an increase of Bacteroides spp (p<0.05) in active CD, in inactive CD and UC samples, and a decrease in C. leptum group (IV) and Faecalibacterium prausnitzi (p<0.05) in both active and inactive IBD patients. Concerning the NOD2/CARD15 mutations, no significant association between bacterial translocation and NOD2/CARD15 was found. The composition of the microbiota in IBD patients differs from that of healthy controls. The high rate of bacterial DNA in the blood samples indicates translocation of bacteria from the gut to the circulation in inflammatory bowel disease.

Το μικροβίωμα του εντέρου πιστεύεται ότι παίζει σημαντικό ρόλο στην ανάπτυξη των φλεγμονωδών νοσημάτων του εντέρου, τη νόσο Crohn και την ελκώδη κολίτιδα. Πρόσφατα, έχει προταθεί ότι υπάρχουν μικρόβια εντέρου στο λιπώδη ιστό και στο περιφερικό αίμα τα οποία μπορούν να προκαλέσουν φλεγμονή. Σκοπός της παρούσας μελέτης είναι να αξιολογήσει τη βακτηριακή διαμετάθεση στα ιδιοπαθή φλεγμονώδη νοσήματα του εντερου. Συλλέχθηκαν δείγματα βιοψιών εντέρου και αίματος από ενήλικες ασθενείς με ενεργό CD (n = 6), CD σε ύφεση (n = 6), ενεργό UC (n = 14) και UC σε ύφεση (n = 20), όπως επίσης και από υγιείς ασθενείς που υποβλήθηκαν προληπτικά σε κολονοσκόπηση. Συλλέχθηκαν και πρωτοδιαγνωσμένοι ασθενείς, ενώ κανείς από του ασθενείς δεν λάμβανε αντιβιοτική αγωγή. Χρησιμοποιώντας μια ευαίσθητη μέθοδο PCR (RT-qPCR), προσδιορίστηκε η σύσταση της μικροχλωρίδας. Επίσης μελετήθηκε ο πολυμορφισμός του γονιδίου NOD2/CARD15. Από τα αποτελέσματα, διαπιστώθηκε αυξημένη ολική συγκέντρωση μικροβιακού DNA στα δείγματα ιστών και αίματος των ασθενών με CD και UC σε σύγκριση με τους υγιείς μάρτυρες (p <0.05). Επιπλέον, οι ασθενείς με ΙΦΝΕ και φλεγμονή στο έντερο είχαν αυξημένες συγκεντρώσεις ολικού μικροβιακού DNA σε σύγκριση με τους ασθενείς με ΙΦΝΕ σε ύφεση (p <0,05). Σε σύγκριση με τους υγιείς μάρτυρες, παρατηρήθηκε αύξηση του Bacteroides spp στους ασθενείς με CD με ενεργότητα νόσου και ύφεση, όπως επίσης και στους ασθενείς με UC σε ύφεση. Επίσης οι ασθενείς με ΙΦΝΕ είχαν μειωμένες συγκεντρώσεις του C. leptum και του Faecalibacterium prausnitzi σε σχέση με τους υγιείς μάρτυρες. Όσον αφορά τους πολυμορφισμούς του γονιδίου NOD2/CARD15, δεν παρατηρήθηκε στατιστικά σημαντική σχέση μεταξύ βακτηριακής διαμετάθεσης και NOD2/CARD15 πολυμορφισμών. Συμπερασματικά, η σύνθεση της μικροχλωρίδας στους ασθενείς με ΙΦΝΕ διαφέρει από αυτή των υγιών ασθενών.