Μοριακός χαρακτηρισμός, μελέτη των εξελικτικών σχέσεων και ανίχνευση ιών της οικογένειας Closteroviridae που σχετίζονται με την ασθένεια μικροκαρπίας της κερασιάς

Περίληψη

Στόχος της παρούσας εργασίας ήταν η διερεύνηση της παρουσίας της ασθένειας της μικροκαρπίας της κερασιάς (LChD) στην Ελλάδα και ο χαρακτηρισμός των ιών που σχετίζονται με αυτήν. Για το σκοπό αυτό πραγματοποιήθηκε επισκόπηση οπωρώνων κερασιάς και άλλων ειδών πυρηνοκάρπων για την παρουσία των Little cherry virus 1 και -2 (LChV-1 και -2). Στην περίπτωση του LChV-1, οι διαθέσιμες στη βιβλιογραφία δοκιμές RT-PCR παρουσίασαν περιορισμένη ευαισθησία ανίχνευσης και για το λόγο αυτό αναπτύχθηκε μία νέα εστιασμένη RT-PCR δοκιμή η οποία και χρησιμοποιήθηκε για την ανίχνευση του ιού στο φυτικό υλικό που συλλέχθηκε. Κατά τον έλεγχο δεν διαπιστώθηκε η παρουσία του LChV-2 σε κερασιά και βυσσινιά. Αντίθετα, ο LChV-1 είναι αρκετά διαδεδομένος στην κερασιά, ενώ ανιχνεύθηκε για πρώτη φορά στην Ελλάδα σε βυσσινιά, δαμασκηνιά και ροδακινιά. Επιπλέον, μελετήθηκε η γενετική διαφοροποίηση του LChV-1 και προσδιορίστηκαν οι εξελικτικοί μηχανισμοί που διαμορφώνουν τη δομή του πληθυσμού του. Για το σκοπό αυτό συλ ...
περισσότερα

Περίληψη σε άλλη γλώσσα

The objective of this work was to study the presence of Little cherry disease (LChD) in Greece and to characterize the viruses associated with it. For that purpose, field surveys were conducted in stone fruit orchards and samples were tested for the presence of Little cherry virus 1 and -2 (LChV-1 and -2). As long as available in the literature LChV-1 specific RT-PCR assays exhibited limited diagnostic sensitivity, a new nested RT-PCR was developed and used for screening the collected plant material. LChV-2 was not detected in any of the sweet and sour cherries samples tested. On the other hand, LChV-1 was prevalent in sweet cherry, whereas it was also detected for the first time in Greece in sour-cherry, plum and peach trees. The genetic diversification of this virus and the evolutionary mechanisms shaping its population structure were also studied. For that purpose, several LChV-1 isolates from diverse hosts and regions of Greece were collected and used in the present study. Part of ...
περισσότερα
Πρέπει να είστε εγγεγραμένος χρήστης για έχετε πρόσβαση σε όλες τις υπηρεσίες του ΕΑΔΔ  Είσοδος /Εγγραφή

Όλα τα τεκμήρια στο ΕΑΔΔ προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα.

Διεύθυνση Handle
http://hdl.handle.net/10442/hedi/36466
ND
36466
Εναλλακτικός τίτλος
Molecular characterization, evolutionary relationships andetection of viruses of the family Closteroviridae related with Little Cherry Disease.
Συγγραφέας
Κατσιάνη, Ασημίνα Θωμάς
Ημερομηνία
2015
Ίδρυμα
Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης (ΑΠΘ). Σχολή Γεωπονίας, Δασολογίας και Φυσικού Περιβάλλοντος. Τμήμα Γεωπονίας. Τομέας Φυτοπροστασίας. Εργαστήριο Φυτοπαθολογίας
Εξεταστική επιτροπή
Κατής Νικόλαος
Μαρκουλάτος Παναγιώτης
Χατζηβασιλείου Ελισάβετ
Βαρβέρη Χριστίνα
Χατζηλουκάς Ευστάθιος
Δόβας Χρυσόστομος
Μαλιόγκα Βαρβάρα
Επιστημονικό πεδίο
Γεωργικές Επιστήμες
Άλλες Γεωργικές Επιστήμες
Λέξεις-κλειδιά
Εξέλιξη ειδών
Χώρα
Ελλάδα
Γλώσσα
Ελληνικά
Άλλα στοιχεία
172 σ., εικ., πιν., σχημ., γραφ., ευρ.