Ολοκλήρωση και οπτικοποίηση δεδομένων πρωτεομικής ανάλυσης

Περίληψη

Στη μεταγενομική εποχή, η πρωτεομική ορίζεται ως η μεγάλης κλίμακας ανάλυση σύνθετων πρωτεϊνικών μειγμάτων, η οποία περιλαμβάνει την αναγνώριση και ποσοτικοποίηση πρωτεϊνών, τον προσδιορισμό πρωτεϊνικών τροποποιήσεων, αλληλεπιδράσεων, δραστηριοτήτων και λειτουργιών. Μια πρωτεομική ανάλυση αποτελείται από πολλά επιμέρους πειραματικά στάδια αλλά και από το στάδιο της μετα-ανάλυσης κατά το οποίο η γνώση που προέρχεται από την πρωτεομική εμπλουτίζεται από πληροφορία που βρίσκεται σε βάσεις δεδομένων, οντολογίες αλλά και την βιβλιογραφία. Συνεπώς, στο τέλος ενός πειράματος ένας ερευνητής έρχεται αντιμέτωπος με μια πληθώρα ασύνδετων πρωτεομικών χαρακτηριστικών τα οποία καλείται να οργανώσει, συσχετίσει και κατηγοριοποιήσει ώστε να εντοπίσει ενδιαφέροντα ευρήματα που σχετίζονται με τον βιολογικό σκοπό μιας μελέτης. Παρότι ορισμένα από τα υπάρχοντα λογισμικά που χρησιμοποιούνται στην πρωτεομική παρέχουν τη δυνατότητα συσχέτισης ορισμένων τέτοιου είδους δεδομένων, ωστόσο η από κοινού οπτικοποί ...
περισσότερα

Περίληψη σε άλλη γλώσσα

High-throughput technologies and the promising experimental approaches used in proteomics, result in a great accumulation of proteomic features. These heterogeneous features (e.g., hand-annotated gel images, tabular data, database results) originate from different software and databases, vary in the format they are saved and are usually distributed in multiple locations. Despite this diversity and the fact that they originate from different stages of a proteomics analysis, there is a vital need for their integration and combined representation that would facilitate the researchers to perform the significant tasks of data analysis and results interpretation. Currently, the available software tools do not provide the capabilities of integrating and presenting any type of proteomics data efficiently and effectively. We have perceived these needs as an information visualization challenge that should be addressed in order to reinforce human cognition and reasoning. In this thesis we propose ...
περισσότερα

Όλα τα τεκμήρια στο ΕΑΔΔ προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα.

DOI
10.12681/eadd/17517
Διεύθυνση Handle
http://hdl.handle.net/10442/hedi/17517
ND
17517
Εναλλακτικός τίτλος
Integration and visualization of proteomics data
Συγγραφέας
Γιαννοπούλου, Ευγενία
Ημερομηνία
2009
Ίδρυμα
Πανεπιστήμιο Πελοποννήσου. Σχολή Θετικών Επιστημών και Τεχνολογίας. Τμήμα Επιστήμης και Τεχνολογίας Υπολογιστών
Εξεταστική επιτροπή
Λέπουρας Γεώργιος
Βαζιργιάννης Μιχαήλ
Βασιλάκης Κωνσταντίνος
Κοσσίδα Σοφία
Μανωλάκος Ηλίας
Παναγιώτου Γεώργιος
Πλατής Νικόλαος
Επιστημονικό πεδίο
Φυσικές ΕπιστήμεςΕπιστήμες Ηλεκτρονικών Υπολογιστών & Πληροφορικής
Λέξεις-κλειδιά
Πρωτεομική; Οπτικοποίηση; Πρωτεομικά χαρακτηριστικά; Ολοκλήρωση πρωτεομικών δεδομένων; Βιοπληροφορική
Χώρα
Ελλάδα
Γλώσσα
Αγγλικά
Άλλα στοιχεία
216 σ., εικ., ευρ.
Στατιστικά χρήσης
ΠΡΟΒΟΛΕΣ
Αφορά στις μοναδικές επισκέψεις της διδακτορικής διατριβής για την χρονική περίοδο 07/2018 - 07/2023.
Πηγή: Google Analytics.
ΞΕΦΥΛΛΙΣΜΑΤΑ
Αφορά στο άνοιγμα του online αναγνώστη για την χρονική περίοδο 07/2018 - 07/2023.
Πηγή: Google Analytics.
ΜΕΤΑΦΟΡΤΩΣΕΙΣ
Αφορά στο σύνολο των μεταφορτώσων του αρχείου της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
ΧΡΗΣΤΕΣ
Αφορά στους συνδεδεμένους στο σύστημα χρήστες οι οποίοι έχουν αλληλεπιδράσει με τη διδακτορική διατριβή. Ως επί το πλείστον, αφορά τις μεταφορτώσεις.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
Σχετικές εγγραφές (με βάση τις επισκέψεις των χρηστών)