Study of mutations and expression of genes correlated to the appearance of colorectal cancer

Abstract

The aim of the current study was to analyse the mutational profile of RAS oncogene correlated to the expression levels of genes related to energy metabolism, hypoxia and genomic stability, as well as the expression levels of microRNAs and their role in regulating the previously mentioned signalling pathways in colorectal tumours. Tasks: • Analysis of the RAS oncogene mutational status and profile of patients’ colorectal cancer tumours. • Analysis of the expression levels of SIRT6, FOXO4 and HIF3A genes of all patients’ tumours compared to healthy colon tissue and correlation to RAS mutational status and according to patient staging. • Correlation between the expression of SIRT6, FOXO4 and HIF3A genes in all patients’ tumours, according to RAS mutation status and patient staging. • Analysis of the expression levels of miR-143, miR-200c, miR-101, miR-34b and miR-375 microRNAs of all CRC patients compared to healthy colon tissue and correlation to RAS mutational status and according to patient staging. • Correlation between SIRT6, FOXO4, HIF3A genes and miR-143, miR-200c, miR-101, miR-34b and miR-375 microRNAs in CRC patients, according to RAS mutational status and patient staging

Ο στόχος της παρούσας μελέτης ήταν η ανάλυση του προφίλ μετάλλαξης του ογκογονιδίου RAS που σχετίζεται με τα επίπεδα έκφρασης γονιδίων που σχετίζονται με τον ενεργειακό μεταβολισμό, την υποξία και τη γονιδιωματική σταθερότητα, καθώς και τα επίπεδα έκφρασης των microRNA και τον ρόλο τους στη ρύθμιση των προαναφερθέντων μονοπατιών σηματοδότησης, σε όγκους του παχέος εντέρου. Καθήκοντα: • Ανάλυση της κατάστασης μετάλλαξης του ογκογονιδίου RAS και του προφίλ των όγκων του παχέος εντέρου. • Ανάλυση των επιπέδων έκφρασης των γονιδίων SIRT6, FOXO4 και HIF3A των όγκων όλων των ασθενών σε σύγκριση με τον υγιή ιστό του παχέος εντέρου και συσχέτιση με την κατάσταση μετάλλαξης του RAS και σύμφωνα με τη σταδιοποίηση του ασθενούς. • Συσχέτιση μεταξύ της έκφρασης των γονιδίων SIRT6, FOXO4 και HIF3A σε όλους τους όγκους των ασθενών, σύμφωνα με την κατάσταση μετάλλαξης του RAS και τη σταδιοποίηση του ασθενούς. • Ανάλυση των επιπέδων έκφρασης των microRNA miR-143, miR-200c, miR-101, miR-34b και miR-375 των ασθενών με CRC σε σύγκριση με τον υγιή ιστό του παχέος εντέρου και συσχέτιση με την κατάσταση μετάλλαξης του RAS και σύμφωνα με τη σταδιοποίηση του ασθενούς. • Συσχέτιση μεταξύ των γονιδίων SIRT6, FOXO4, HIF3A και των microRNAs miR-143, miR-200c, miR-101, miR-34b και miR-375 σε ασθενείς με CRC, σύμφωνα με το προφίλ μετάλλαξης του RAS και τη σταδιοποίηση του ασθενούς.