Εξακρίβωση της προγνωστικής αξίας γονιδιωματικών δεικτών στην πρόγνωση του καρκίνου, με μετα – ανάλυση

Abstract

Comparative study and meta – analysis of meta analysis studies for the correlation of genomic markers with early cancer detection.A large number of common disorders, including cancer, have complex genetic traits, with multiple genetic and environmental components contributing to susceptibility. A literature search revealed that even among several meta-analyses, there were ambiguous results and conclusions. In the current study, we conducted a thorough meta-analysis gathering the published meta-analysis studies previously reported to correlate any random effect or predictive value of genome variations in certain genes for various types of cancer. The overall analysis was initially aimed to result in associations (1) among genes which when mutated lead to different types of cancer (e.g. common metabolic pathways) and (2) between groups of genes and types of cancer. We have meta-analysed 150 meta-analysis articles which included 4,474 studies, 2,452,510 cases and 3,091,626 controls (5,544,136 individuals in total) including various racial groups and other population groups (native Americans, Latinos, Aborigines, etc.). Our results were not only consistent with previously published literature but also depicted novel correlations of genes with new cancer types. Our analysis revealed a total of 17 gene–disease pairs that are affected and generated gene/disease clusters, many of which proved to be independent of the criteria used, which suggests that these clusters are biologically meaningful.

Ένας μεγάλος αριθμός κοινών ασθενειών συμπεριλαμβανομένου του καρκίνου έχουν περίπλοκο γενετικό υπόβαθρο με πολλαπλές γενετικές και περιβαλλοντικές παραμέτρους που συμβάλλουν στην προδιάθεση. Μια βιβλιογραφική αναζήτηση μεταξύ των διάφορων μετα-αναλύσεων δείχνει ότι υπάρχουν αντικρουόμενα αποτελέσματα και συμπεράσματα. Στην παρούσα μελέτη, έγινε μια μετα-ανάλυση συγκεντρώνοντας δημοσιευμένες μετα-αναλύσεις που έχουν δείξει ότι υπάρχει συσχέτιση μεταξύ μιας τυχαίας επίδρασης με κάποιο τύπο ή τύπους καρκίνου ή υπάρχει προγνωστική αξία μιας γονιδιακής αλλαγής σε γονίδια που σχετίζονται με διάφορους τύπους καρκίνου. Η συνολική ανάλυση αρχικά είχε σκοπό να αναδείξει συσχετίσεις (1) μεταξύ γονιδίων που όταν υφίστανται μεταλλάξεις οδηγούν σε διαφορυς τύπους καρκίνου και (2) μεταξύ ομάδων γονιδίων και τύπων καρκίνου. Στην παρούσα μετα-ανάλυση χρησιμοποιήθηκαν 150 μετα-αναλύσεις οι οποίες περιλάμβαναν 4.474 μελέτες, 2.452.510 περιστατικά και 3.091.626 μάρτυρες (5.544.136 άτομα στο σύνολο) συμπεριλαμβάνοντας διάφορες ομάδες από διάφορες, εθνότητες και ομάδες όπως Αμερικανοί, Λατίνοι, Αβοριγινοί κ.α. Τα αποτελέσματά μας ήταν όχι μόνο σε συμφωνία με προηγούμενα δημοσιευμένα αποτελέσματα αλλά ανέδειξαν και νέες συσχετίσεις μεταξύ γονιδίων και διάφορων τύπων καρκίνου. Η ανάλυσή μας έδειξε 17 ζεύγη γονιδίων-τύπων καρκίνου που επηρεάζονται και δημιουργούν ομάδες γονιδίων, πολλά από τα οποία είναι ανεξάρτητα από τα κριτήρια που τέθηκαν, το οποίο δείχνει ότι έχουν βιολογική σημασία.