Ανάπτυξη μεθόδων βιοπληροφορικής για την ανάδειξη δικτυακών υπογραφών με σκοπό την κατανόηση μοριακών μηχανισμών και την διερεύνηση υποψήφιων φαρμάκων
Περίληψη
Οι βιολογικές συστημικές προσεγγίσεις είναι ουσιαστικής σημασίας για την ανακάλυψη γονιδίων, που σχετίζονται με διαφορετικές ασθένειες, προσφέροντας μια διαφορετική προοπτική και νέα εργαλεία για την ανάλυση διαφόρων τύπων μοριακών σχέσεων, όπως η γονιδιακή συν-έκφραση ή οι αλληλεπιδράσεις μεταξύ πρωτεϊνών. Ωστόσο, λόγω της έλλειψης πειραματικών πληροφοριών, η ανάλυση αυτή δεν εφαρμόζεται πλήρως. Ο σκοπός της μελέτης αυτής, είναι να αποκαλύψει την πολύ ισχυρή συμβολή στατιστικών μεθόδων κατασκευής γονιδιακών δικτύων συν-έκφρασης ή των μεθόδων επαγωγής δικτυακής συσχέτισης, όπως ονομάζονται, που βασίζονται στις DNA μικροσυστοιχίες για την ανάδειξη σημαντικών γονιδίων και γονιδιακών αλληλεπιδράσεων. Ερευνήθηκε η ικανότητα των μεθόδων αυτών στην ανάδειξη και ιεράρχηση γονιδίων για τους διαφορετικούς τύπους και στάδια του καρκίνου του μαστού μέσα από: 1) ένα σχήμα ταξινόμησης, όπου αξιολογήθηκε η απόδοσή τους 2) την εύρεση ισχυρών δικτυακών υπογραφών, από τις ισχυρές γονιδιακές ακμές που δ ...
περισσότερα
Περίληψη σε άλλη γλώσσα
Systemic approaches are essential in the discovery of disease-specific genes, offering a different perspective and new tools on the analysis of several types of molecular relationships, such as gene co-expression or protein-protein interactions. However, due to lack of experimental information, this analysis is not fully applicable. The aim of this study is to reveal the multi-potent contribution of statistical network inference methods in highlighting significant genes and interactions. We have investigated the ability of statistical co-expression networks to highlight and prioritize genes for breast cancer subtypes and stages in terms of: 1) classification efficiency, 2) gene network pattern conservation, 3) indication of involved molecular mechanisms and 4) systems level momentum to drug repurposing pipelines. To enhance this methodology, two models were developed based on the random walks theory, where the one highlights disease-specific genes by examining the correlations of the m ...
περισσότερα
Κατεβάστε τη διατριβή σε μορφή PDF (13.72 MB)
(Η υπηρεσία είναι διαθέσιμη μετά από δωρεάν εγγραφή)
|
Όλα τα τεκμήρια στο ΕΑΔΔ προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα.
|
Στατιστικά χρήσης
ΠΡΟΒΟΛΕΣ
Αφορά στις μοναδικές επισκέψεις της διδακτορικής διατριβής για την χρονική περίοδο 07/2018 - 07/2023.
Πηγή: Google Analytics.
Πηγή: Google Analytics.
ΞΕΦΥΛΛΙΣΜΑΤΑ
Αφορά στο άνοιγμα του online αναγνώστη για την χρονική περίοδο 07/2018 - 07/2023.
Πηγή: Google Analytics.
Πηγή: Google Analytics.
ΜΕΤΑΦΟΡΤΩΣΕΙΣ
Αφορά στο σύνολο των μεταφορτώσων του αρχείου της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
ΧΡΗΣΤΕΣ
Αφορά στους συνδεδεμένους στο σύστημα χρήστες οι οποίοι έχουν αλληλεπιδράσει με τη διδακτορική διατριβή. Ως επί το πλείστον, αφορά τις μεταφορτώσεις.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.