Μελέτη του ιού του ποικιλοχλωρωτικού νανισμού της μελιτζάνας (Eggplant mottled dwarf virus, EMDV)

Περίληψη

Ο ιός του ποικιλοχλωρωτικού νανισμού της μελιτζάνας (Eggplant mottled dwarf virus, EMDV) ανήκει στο γένος Nucleorhabdovirus της οικογένειας Rhabdoviridae. Παρόλο που απαντάται σποραδικά εδώ και πολλά χρόνια στη Μεσογειακή λεκάνη σε καλλιεργούμενα, καλλωπιστικά φυτά και αυτοφυή ζιζάνια, μέχρι σήμερα δεν είχε προσδιοριστεί η νουκλεοτιδική αλληλουχία και η οργάνωση του γονιδιώματος του. Στην παρούσα διατριβή, προσδιορίστηκε για πρώτη φορά το γονιδίωμα μιας απομόνωσης του EMDV, με μία νέα στρατηγική που χρησιμοποιεί τις εξαιρετικά συντηρημένες, μεταξύ των γονιδίων, περιοχές του ιού. Το αρνητικής πολικότητας, μονόκλωνο RNA γονιδίωμα του EMDV είναι μήκους 13.093 νουκλεοτιδίων και περιέχει 7 ανοιχτά πλαίσια ανάγνωσης (ΑΠΑ) τα οποία οργανώνονται σε κατεύθυνση 3' προς 5' και δυνητικά κωδικοποιούν επτά πρωτεΐνες, την Νουκλεοπρωτεΐνη Ν, την Χ άγνωστης λειτουργίας πρωτεΐνη, την Φωσφοπρωτεΐνη Ρ, την υποθετική πρωτεΐνη διακυτταρικής μετακίνησης Υ, την Βασική πρωτεΐνη περιβλήματος Μ, την Γλυκοπρωτεΐν ...
περισσότερα

Περίληψη σε άλλη γλώσσα

Eggplant mottled dwarf virus (EMDV) is classified in the genus Nucleorhabdovirus family Rhabdoviridae. Even though it is sporadically found since many years ago in cultivated, ornamental plants and weeds in the Mediterranean Basin, its genome sequence and organization were unknown. In the present study the complete nucleotide sequence of EMDV was determined employing a strategy that takes advantage of the virus untranslated conserved intergenic regions. The negative polarity, single-stranded RNA genome is 13,093 nucleotides long, and contains seven open reading frames (ORFs) organized in the order 3’ to 5’ which potentially encode a nucleocapsid (N), a X unknown protein, a phosphoprotein (P), a putative movement protein (Y), a matrix protein (M), a glycoprotein (G) and a polymerase (L). At the 3’ end of the genome, a leader sequence precedes the N gene, while at the 5' end of the genomic RNA, a terminal sequence, follows the L coding gene. Among the above genes, the size of each untr ...
περισσότερα
Πρέπει να είστε εγγεγραμένος χρήστης για έχετε πρόσβαση σε όλες τις υπηρεσίες του ΕΑΔΔ  Είσοδος /Εγγραφή

Όλα τα τεκμήρια στο ΕΑΔΔ προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα.

Διεύθυνση Handle
http://hdl.handle.net/10442/hedi/37191
ND
37191
Εναλλακτικός τίτλος
Study of Eggplant mottled dwarf virus, EMDV
Συγγραφέας
Παππή, Πολυξένη Γεώργιος
Ημερομηνία
2014
Ίδρυμα
Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης (ΑΠΘ). Σχολή Γεωπονίας, Δασολογίας και Φυσικού Περιβάλλοντος. Τμήμα Γεωπονίας. Τομέας Φυτοπροστασίας. Εργαστήριο Φυτοπαθολογίας
Εξεταστική επιτροπή
Κατής Νικόλαος
Χατζηλουκάς Ευστάθιος
Χατζηβασιλείου Ελισάβετ
Βαρβέρη Χριστίνα
Μαρκουλάτος Παναγιώτης
Δόβας Χρυσόστομος
Μαλιόγκα Βαρβάρα
Επιστημονικό πεδίο
Γεωργικές Επιστήμες
Γεωργία, Δασοκομία, και Αλιεία
Λέξεις-κλειδιά
Ιός του ποικιλοχλωρωτικού νανισμού της μελιτζάνας; Ποσοτική πραγματικού χρόνου αντίστροφη μεταγραφή αλυσιδωτή αντίδραση της πολυμεράσης; Φυλογενετική ανάλυση; Πρωτόκολλα εκχύλισης ολικού RNA
Χώρα
Ελλάδα
Γλώσσα
Ελληνικά
Άλλα στοιχεία
210,σ., εικ., πιν., σχημ., γραφ., ευρ.