Χρήση προηγμένων μεθόδων επεξεργασίας σήματος στην ανάλυση βιολογικών σημάτων και γενετικών ακολουθιών

Περίληψη

Η διατριβή πραγματεύεται το πρόβλημα του σαφούς εντοπισμού και ανίχνευσης διαμεμβρανικών τμημάτων σε πρωτεϊνικές ακολουθίες και την κατηγοριοποίησή τους. Προηγμένες μέθοδοι επεξεργασίας σήματος αναπτύσσονται, ολοκληρώνονται και προσαρμόζονται στην αντιμετώπιση του προβλήματος. Ανιχνεύουν τη θέση και τα άκρα(έναρξη και λήξη) αυτών των περιοχών σε μεγάλες ακολουθίες αμινοξέων. Η στατιστική ανώτερης τάξης, τα κυματίδια και η γνώση βιοχημικών ιδιοτήτων καθορισμένων περιοχών, συνδυάζονται σε διάφορα μεγέθη οδηγώντας σε νέες προσεγγίσεις που αποδεικνύεται πως προσδιορίζουν αποτελεσματικά τη θέση διαμεμβρανικών τμημάτων και για πρώτη φορά παρέχουν εφαρμόσιμες λύσεις στο πρόβλημα. Αναπτύσσονται δύο μέθοδοι, η Κ4ΗΤΜ και η CWTHTM, με διαφορετικά, ωστόσο αλληλοσυμπληρούμενα χαρακτηριστικά και εφαρμόζονται στο πρόβλημα. Η πρώτη προϋποθέτει μια εκ των προτέρων εκπαίδευση και χρήση γνώσης για συγκεκριμένες περιοχές, ενώ η δεύτερη είναι πιο γενική και επιπλέον περισσότερο ευέλικτη στον εντοπισμό περι ...
περισσότερα

Περίληψη σε άλλη γλώσσα

The dissertation tackles the problem of reliable localization and identification of transmembrane segments in protein sequences and their effective categorization. Advanced signal processing methods are developed, integrated and brought to bear on the solution of the problem. They detect the position and endpoints (beginning and end) of these components on large sequences of aminoacids. Higher order statistics, wavelets, and domain specific knowledge of biochemical properties, combine in various measures to form new approaches which are shown to effectively identify the location of the transmembrane segments and for the first time provide different yet complementary features are developed and applied to the problem. The first one requires some prior training and domain-specific knowledge while the second one is more generic and yet more flexible in identifying segments without prior knowledge. An energy-based approach is developed for effective categorization and complexity analysis is ...
περισσότερα

Όλα τα τεκμήρια στο ΕΑΔΔ προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα.

DOI
10.12681/eadd/19425
Διεύθυνση Handle
http://hdl.handle.net/10442/hedi/19425
ND
19425
Εναλλακτικός τίτλος
Use of advanced signal processing methods in analyzing biological signals and genetic sequences
Συγγραφέας
Κίτσας, Ηλίας του Κωνσταντίνος
Ημερομηνία
2008
Ίδρυμα
Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης (ΑΠΘ). Σχολή Πολυτεχνική. Τμήμα Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών
Εξεταστική επιτροπή
Πανάς Σταύρος
Σεργιάδης Γεώργιος
Τσουκαλάς Ελευθέριος
Γεωργιάδης Λεωνίδας
Βαβάτση-Χριστάκη Νόρμα
Σκούρας Ζαχαρίας
Χατζηλεοντιάδης Λεόντιος
Επιστημονικό πεδίο
Επιστήμες Μηχανικού και Τεχνολογία
Επιστήμη Ηλεκτρολόγου Μηχανικού, Ηλεκτρονικού Μηχανικού, Μηχανικού Η/Υ
Λέξεις-κλειδιά
Επεξεργασία σήματος; Βιοπληροφορική; Διαμεμβρανικά τμήματα; Στατιστική ανώτερης τάξης; Μετασχηματισμός κυματιδίων; Κατηγοριοποίηση πρωτεϊνών
Χώρα
Ελλάδα
Γλώσσα
Ελληνικά
Άλλα στοιχεία
x, 121 σ., εικ.
Στατιστικά χρήσης
ΠΡΟΒΟΛΕΣ
Αφορά στις μοναδικές επισκέψεις της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Google Analytics.
ΞΕΦΥΛΛΙΣΜΑΤΑ
Αφορά στο άνοιγμα του online αναγνώστη.
Πηγή: Google Analytics.
ΜΕΤΑΦΟΡΤΩΣΕΙΣ
Αφορά στο σύνολο των μεταφορτώσων του αρχείου της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
ΧΡΗΣΤΕΣ
Αφορά στις μοναδικές επισκέψεις της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
Σχετικές εγγραφές (με βάση τις επισκέψεις των χρηστών)