Μοριακός χαρακτηρισμός, εξελικτικές σχέσεις και ανίχνευση ιών της αμπέλου ενός διακριτού φυλογενετικού κλάδου του γένους ampelovirus και εξυγίανση πολλαπλασιαστικού υλικού

Περίληψη

Τα τελευταία χρόνια πολλοί νέοι ιοί σχετιζόμενοι με την ασθένεια συστροφής των φύλλων της αμπέλου (Grapevine leafroll associated viruses, GLRaVs) απομονώθηκαν παγκοσμίως από διάφορες ποικιλίες. Μέχρι πρόσφατα αυτοί οι ιοί ανέρχονταν στους 9, ενώ άλλες δύο απομονώσεις (προσωρινές ονομασίες GLRaV-Pr και GLRaV-De) προσδιορίστηκαν επίσης από Ελληνικές ποικιλίες αμπέλου. Οι περισσότεροι από αυτούς τους ιούς κατατάσσονται στο νέο-ιδρυθέν γένος Ampelovirus της οικογένειας Closteroviridae. Mε βάση φυλογενετικές αναλύσεις αλληλουχιών τμήματος της ομόλογης HSP70 πρωτεΐνης (HSP70h) oι GLRaV-4, -5, -6, -9, -Pr και -De σχετίζονται περισσότερο μεταξύ τους σε σχέση με τους άλλους GLRaVs. Αυτή η ομάδα ιών, που περιλαμβάνει τους περισσότερους GLRaVs, είναι ελάχιστα μελετημένη, με προβλήματα στον χαρακτηρισμό, την ταξινόμηση και την ανίχνευσή τους. Στην παρούσα διατριβή μελετήθηκαν οι εξελικτικές σχέσεις αυτών των ιών με τη βοήθεια αναλύσεων γενετικής παραλλακτικότητας, θετικής επιλογής και φυλογενειών ...
περισσότερα

Περίληψη σε άλλη γλώσσα

During the last decades new leafroll associated viruses (GLRaVs) have been isolated from grapevine. As a result GLRaVs were raised to 9 while two new isolates (temporary designations GLRaV-Pr and GLRaV-De) were recently determined from Greek grapevine varieties. The majority of these viruses are classified within the recently established genus Ampelovirus of the family Closteroviridae. Based on phylogenies of partial HSP70h sequences, GLRaV-4, -5, -6, -9, -Pr and -De were found to be more closely related to each other compared to the other GLRaVs. This virus group that includes most of the GLRaVs is barely studied, with problems on their characterization, taxonomy and detection. In this study the evolutionary relationships of this virus group were studied based on molecular variability, positive selection analysis and maximum likelihood (ML) phylogenies. Additional sequences from different isolates were determined and datasets corresponding to the N terminal HSP70h and full CP genes we ...
περισσότερα

Όλα τα τεκμήρια στο ΕΑΔΔ προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα.

DOI
10.12681/eadd/18901
Διεύθυνση Handle
http://hdl.handle.net/10442/hedi/18901
ND
18901
Εναλλακτικός τίτλος
Molecular characterization, evolutionary relationships and detection of grapevine viruses belonging to a distinct phylogenetic cluster of the genus ampelovirus and virus elimination of propagating material
Συγγραφέας
Μαλιόγκα, Βαρβάρα του Ιωάννης
Ημερομηνία
2008
Ίδρυμα
Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης (ΑΠΘ). Σχολή Γεωπονική. Τομέας Φυτοπροστασίας
Εξεταστική επιτροπή
Κατής Νικόλαος
Τζαβέλα-Κλωνάρη Αικατερίνη
Κυριακοπούλου Παναγιώτα
Αρσενάκης Μηνάς
Μαρκουλάτος Παναγιώτης
Χατζηλουκάς Ευστάθιος
Χατζηβασιλείου Ελισάβετ
Επιστημονικό πεδίο
Γεωπονικές Επιστήμες και Κτηνιατρική
Γεωπονία, Δασολογία και Αλιεία
Λέξεις-κλειδιά
Αμπέλια; Εξέλιξη; Φυλογενετική ανάλυση; Ταξινόμηση; Μοριακή ανίχνευση; Ορολογική ανίχνευση; Εξυγίανση
Χώρα
Ελλάδα
Γλώσσα
Ελληνικά
Άλλα στοιχεία
198 σ., εικ.
Στατιστικά χρήσης
ΠΡΟΒΟΛΕΣ
Αφορά στις μοναδικές επισκέψεις της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Google Analytics.
ΞΕΦΥΛΛΙΣΜΑΤΑ
Αφορά στο άνοιγμα του online αναγνώστη.
Πηγή: Google Analytics.
ΜΕΤΑΦΟΡΤΩΣΕΙΣ
Αφορά στο σύνολο των μεταφορτώσων του αρχείου της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
ΧΡΗΣΤΕΣ
Αφορά στις μοναδικές επισκέψεις της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
Σχετικές εγγραφές (με βάση τις επισκέψεις των χρηστών)