Χαρακτηρισμός εναλλακτικού μεταγράφου της πολυ(Α)-εξειδικευμένης ριβονουκλεάσης, PARN, και διερεύνηση του βιολογικού του ρόλου

Περίληψη

Η πολυ(Α) εξειδικευμένη ριβονουκλεάση (PARN) είναι μια αποδενυλάση, ένας τελεστής της αποικοδόμησης του ευκαρυωτικού mRNA που μεσολαβεί στην ρύθμιση της σταθερότητας ποικίλων μη κωδικών RNA. Όπως είναι κοινό για τα περισσότερα γονίδια που κωδικοποιούν για πρωτεΐνες, το γονίδιο της PARN κωδικοποιεί πολλαπλά εναλλακτικά μετάγραφα, τα οποία έχουν ανιχνευθεί από προηγούμες μελέτες αλληλούχισης. Τα εναλλακτικά μετάγραφα της PARN δεν έχουν χαρακτηριστεί βιοχημικά ή μελετηθεί ειδικά. Σε αυτή την εργασία ανιχνεύσαμε την έκφραση ενός εναλλακτικού μεταγράφου της PARN σε κυτταρικές σειρές κακοήθους μεσοθηλιώματος υπεζωκότα (PMM) και ινοβλάστες πνεύμονα, το εναλλακτικό μετάγραφο PARN_v1, συνεκφράζεται με την PARN στις κυτταρικές σειρές μεσοθηλιώματος αλλά όχι στους πνευμονικούς ινοβλάστες. H PARN_v1 εκφράζεται σε επίπεδο mRNA και σε επίπεδο πρωτεΐνης, σε κυτταρικές σειρές που προέρχονται και από τους τρεις υποτύπους κακοήθους μεσοθηλιώματος του υπεζωκότα, ενώ είναι μη ανιχνεύσιμη σε καλοήθη υπεζω ...
περισσότερα

Περίληψη σε άλλη γλώσσα

Poly(A)-specific ribonuclease (PARN) is a deadenylase, an effector of eukariotic mRNA decay that also mediates the maturation of a diverse and expanding repertoire of non-coding RNAs. Not unlike most protein coding genes, PARN encodes for multiple splice variants many, of which have been detected previously by RNA sequencing. Such splice variants have not been biochemically characterized or studied specifically in any context. In this work we detected the expression of a PARN splice variant in pleural malignant mesothelioma (PMM) cell lines and lung fibroblasts, the splice variant is co-expressed along with PARN in the PMM cell lines but not in lung fibroblasts. Our findings reveal that the splice variant is expressed at both the mRNA and protein level, in cell lines derived from all three pleural malignant mesothelioma subtypes, whilst being barely detectable in benign pleural immortalized cells, the highest expression levels were detected in lung fibroblasts. We identified and clo ...
περισσότερα

Όλα τα τεκμήρια στο ΕΑΔΔ προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα.

DOI
10.12681/eadd/55844
Διεύθυνση Handle
http://hdl.handle.net/10442/hedi/55844
ND
55844
Εναλλακτικός τίτλος
Characterization of a poly(A) specific ribonuclease PARN splice variant and investigation of its biological role
Συγγραφέας
Αντωνόπουλος, Διονύσιος (Πατρώνυμο: Άγγελος)
Ημερομηνία
2024
Ίδρυμα
Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας. Σχολή Επιστημών Υγείας. Τμήμα Βιοχημείας και Βιοτεχνολογίας. Εργαστήριο Δομικής και Λειτουργικής Βιοχημείας
Εξεταστική επιτροπή
Μπαλατσός Νικόλαος
Λεωνίδας Δημήτριος
Γουργουλιάνης Κωνσταντίνος
Λιάκος Παναγιώτης
Βλαχάκης Δημήτριος
Καφάσλα Παναγιώτα
Τσιλιώνη Ειρήνη
Επιστημονικό πεδίο
Φυσικές ΕπιστήμεςΒιολογία ➨ Βιοχημεία και Μοριακή βιολογία
Λέξεις-κλειδιά
Πολυ(Α) εξειδικευμένη ριβονουκλεάση; Εναλλακτικό μάτισμα; Πλευριτικό μεσοθηλίωμα; Ινοβλάστες MRC-5; Εξωσώματα; Καρκινικό μικροπεριβάλλον; Πλευριτικό υγρό; PARN
Χώρα
Ελλάδα
Γλώσσα
Ελληνικά
Άλλα στοιχεία
εικ., πιν., σχημ., γραφ.
Στατιστικά χρήσης
ΠΡΟΒΟΛΕΣ
Αφορά στις μοναδικές επισκέψεις της διδακτορικής διατριβής για την χρονική περίοδο 07/2018 - 07/2023.
Πηγή: Google Analytics.
ΞΕΦΥΛΛΙΣΜΑΤΑ
Αφορά στο άνοιγμα του online αναγνώστη για την χρονική περίοδο 07/2018 - 07/2023.
Πηγή: Google Analytics.
ΜΕΤΑΦΟΡΤΩΣΕΙΣ
Αφορά στο σύνολο των μεταφορτώσων του αρχείου της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
ΧΡΗΣΤΕΣ
Αφορά στους συνδεδεμένους στο σύστημα χρήστες οι οποίοι έχουν αλληλεπιδράσει με τη διδακτορική διατριβή. Ως επί το πλείστον, αφορά τις μεταφορτώσεις.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.