Μικρά μόρια - ενεργοποιητές γλυκοσιδικών υδρολασών

Περίληψη

Προηγούμενη ερευνητική εργασία στο Πανεπιστήμιο του York έδειξε ότι μικρά μόρια μπορούν να αυξήσουν την ενεργότητα της βακτηριακής γλυκοσιδικής υδρολάσης, BtGH84. Ο αρχικός στόχος της παρούσας εργασίας ήταν η χρήση μεθόδων αναζήτησης μικρών μορίων για τον εντοπισμό ενεργοποιητών ενζύμων που χρησιμοποιούνται στην αποικοδόμηση της κυτταρίνης κατά την οποία η χαμηλή ενεργότητα αυτών των ενζύμων αποτελεί ανασταλτικό παράγοντα κατά τη βιομηχανική διαδικασία. Η μέθοδος αναζήτησης μικρών μορίων ήταν επιτυχής στην γλυκοσιδική υδρολάσης ενός μύκητα, TrBgl2. Ο χαρακτηρισμός του μηχανισμού ενεργοποίησης αυτού του ενζύμου είναι το επίκεντρο της παρούσας εργασίας. Μια βιβλιοθήκη 560 εμπορικά διαθέσιμων μικρών μορίων ελέγχθηκε μέσω μιας δοκιμασίας ενεργότητας η οποία εντόπισε ένα μικρό μόριο-ενεργοποιητή του TrBgl2. Ο έλεγχος χημικών αναλόγων του αρχικού μικρού μορίου-ενεργοποιητή και η λεπτομερής κινητική ανάλυση εντόπισε μόρια που συμπεριφέρονταν ως «nonessential» ενεργοποιητές του TrBgl2 και ...
περισσότερα

Περίληψη σε άλλη γλώσσα

Previous work at York demonstrated that fragment molecules can increase the activity of the glycoside hydrolase, BtGH84. The initial aim of this project was to use fragment-based discovery methods to identify activators of several enzymes used in cellulose degradation where low activity is one of the limiting steps in the industrial process. This was successful for oneenzyme, the fungal glycoside hydrolase, TrBgl2. The characterisation of the mechanism of activation for this enzyme is the main focus of this thesis.A fragment screen of a library of 560 commercially available fragments using a kinetic assay identified a small molecule activator of TrBgl2. An analogue by catalogue approach and detailed kinetic analysis identified compounds that behaved as nonessential activators with up to a 2-fold increase in maximum activation. The compounds did not activate the related bacterial glycoside hydrolase CcBglA demonstrating specificity. Interestingly, an analogue of the initial fragment inh ...
περισσότερα

Όλα τα τεκμήρια στο ΕΑΔΔ προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα.

DOI
10.12681/eadd/50862
Διεύθυνση Handle
http://hdl.handle.net/10442/hedi/50862
ND
50862
Εναλλακτικός τίτλος
Exploration of fragment-derived modulators of glycoside hydrolases
Συγγραφέας
Μακράκη, Ελένη του Κωνσταντίνος
Ημερομηνία
2020
Ίδρυμα
University of York
Εξεταστική επιτροπή
Gideon Grogan
Επιστημονικό πεδίο
Φυσικές ΕπιστήμεςΒιολογία ➨ Βιοχημεία και Μοριακή βιολογία
Λέξεις-κλειδιά
Υδρολάσες
Χώρα
Ηνωμένο Βασίλειο
Γλώσσα
Αγγλικά
Στατιστικά χρήσης
ΠΡΟΒΟΛΕΣ
Αφορά στις μοναδικές επισκέψεις της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Google Analytics.
ΞΕΦΥΛΛΙΣΜΑΤΑ
Αφορά στο άνοιγμα του online αναγνώστη.
Πηγή: Google Analytics.
ΜΕΤΑΦΟΡΤΩΣΕΙΣ
Αφορά στο σύνολο των μεταφορτώσων του αρχείου της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.
ΧΡΗΣΤΕΣ
Αφορά στις μοναδικές επισκέψεις της διδακτορικής διατριβής.
Πηγή: Εθνικό Αρχείο Διδακτορικών Διατριβών.