Γενετικός πολυμορφισμός των προαγουσών τη φλεγμονή κυτταροκινών και του TGF-β σε ασθενείς με έμφραγμα του μυοκαρδίου

Abstract

As it is known, myocardial infarction and the local necrosis it causes to the myocardium, is a source of inflammation. As in every case of inflammation, the immune system activates, producing cytokines, as a response to the inflicted necrosis, promoting scar formation. This mechanism often acts against the best interest of the organism, leaving a dysfunctional remain of tissue.In genetic level, serious research has taken place in order to combine the polymorphisms of these cytokines and the proteins they produce, either concerning the quantity or their quality, with the frequency of appearance and the way diseases evolve.In our research, we located the most popular and most studied polymorphisms of a pliad of cytokines found in the peripheral blood of patients with myocardial infarction. We compared statistically the results with that of a healthy group of people sharing common characteristics (age, sex, risk factors) and ethnical identity (Greek).We took sample from 65 patients with myocardial infarction and 102 healthy people as control group. DNA extraction was done using the PureLink® Genomic DNA Kit. while its decoding was done using the luminex method. The results was later analyzed using the internet statistical package SNPstats, which specializes in single noucleotid polymorphisms. The aforementioned package is free to use at http://bioinfo.iconcologia.net/SNPstats. The level of significance we used was p<0,05.Studying the bibliography until today, the results concerning each cytokine in separate appear to vary and often are conflicting. The geographical factor seems to play an important role, influencing the results. Our study piles up to the total of the scientific knowledge that there is no relation between myocardial infarction and TGFβ +869, +917, IFNγ +874, IL10 -1082, -819, IL6 -174, TNFα -238, -308, IL12β +1188, IL1α -889. IL1β -511, +3962 and IL1R pst11970 polymorphisms, at least as long as Greek population is concerned. In contrary, there was a firm relation between the disease and the existence of C allele at position -592 of IL10 of our female population. Identically, there seems to be a protective role of the CT genotype, of IL1Ra at gene position mspal11100, to its carriers.We suggest that research continues in this direction, taking seriously in concern the geographical factor, expanding in greater numbers of populations, separating myocardial infarction in STEMI and NSTEMI and finally trying if possible to study various combinations of polymorphisms, either concerning the same cytokine or not, as a unified risk factor of myocardial infarction’s appearance.

Είναι γνωστό πως το έμφραγμα του μυοκαρδίου και η τοπική νέκρωση που προκαλεί στο μυοκάρδιο αποτελεί εστία φλεγμονής του οργανισμού. Όπως σε κάθε περίπτωση φλεγμονής, κινητοποιείται ο ανοσοποιητικός μηχανισμός, με βασικό εκπρόσωπο τις παραγόμενες κυτταροκίνες, αντιμαχόμενος τη νεκρωτική περιοχή και προάγοντας την ουλοποίηση. Ο μηχανισμός αυτός, πολλές φορές δεν επενεργεί υπέρ του συμφέροντος του οργανισμού, εγκαταλείποντας δυσλειτουργικό υπόλοιπο ιστού. Σε γενετικό επίπεδο πολλές μελέτες έχουν γίνει για να συνδυαστούν οι πολυμορφισμοί των κυτταροκινών και οι παραγόμενες εξ αυτών πρωτείνες, είτε σε ποσοτικό είτε σε ποιοτικό επίπεδο, με τη συχνότητα και την εξέλιξη των υπό μελέτη ασθενειών.Στην έρευνά μας εντοπίσαμε τους πιο ευρέα διαδεδομένους και μελετημένους πολυμορφισμούς, οφειλόμενους σε εστιακές μεταλλάξεις του DNA, μιας πλειάδας κυτταρινών στο περιφερικό αίμα ασθενών με έμφραγμα του μυοκαρδίου. Συγκρίναμε στατιστικά τα αποτελέσματά μας με υγιή πληθυσμό όμοιων χαρακτηριστικών (ηλικία, φύλο, παράγοντες κινδύνου) και ιδίας εθνικής ταυτότητος (ελληνικής). Πάρθηκε δείγμα 65 ασθενών με έμφραγμα του μυοκαρδίου και 102 ατόμων του πληθυσμού ελέγχου. Η εξόρυξη του DNA έγινε με τη χρήση του PureLink®Genomic DNA Kit. ενώ η ανάλυση αυτού με τη μέθοδο luminex. Τα αποτελέσματα αναλύθηκαν με το στατιστικό διαδικτυακό πακέτο SNPstats, το οποίο εξειδικεύεται σε πολυμορφισμούς οφειλόμενους σε εστιακές μεταλλάξεις. Το παραπάνω πακέτο βρίσκεται στον ιστότοπο http://bioinfo.iconcologia.net/SNPstats. Το επίπεδο σημαντικότητας ορίστηκε στο p<0,05.Τα αποτελέσματα σε κάθε περίπτωση κυτταροκίνης ξεχωριστά, ποικίλλουν και είναι αντικρουόμενα στα μέχρι τώρα δεδομένα της διεθνούς επιστημονικής κοινότητας. Ο γεωγραφικός παράγοντας δείχνει να παίζει σημαντικό ρόλο στα αποτελέσματα. Η μελέτης μας έρχεται να προσθέσει στα μέχρι τώρα δεδομένα, το μη συσχετισμό με έμφραγμα του μυοκαρδίου των πολυμορφισμών TGFβ +869, +917, IFNγ +874, IL10 -1082, -819, IL6 -174, TNFα -238, -308, IL12β +1188, IL1α -889. IL1β -511, +3962 και IL1R pst11970, στον ελληνικό πάντα πληθυσμό. Αντιθέτως σημαντικός συσχετισμός υπήρξε μεταξύ της νόσου και την ύπαρξη του C αλλήλιου στη θέση -592 της IL10 στο γυναικείο πληθυσμό, όπως και η προστατευτική ιδιότητα του CT γενότυπου, του IL1Ra στη θέση mspal11100 του γονιδίου, που ασκείται στους φορείς του. Προτείνουμε οι μελέτες να συνεχιστούν προς αυτήν την κατεύθυνση, λαμβάνοντας σημαντικά υπόψιν τους το γεωγραφικό παράγοντα, διενεργόντας μελέτες σε μεγαλύτερους πληθυσμούς, διαχωρίζοντας τις κατηγορίες των εμφραγμάτων σε STEMI και NSTEMI και τέλος προσπαθώντας να διερευνήσουν και πιθανούς συνδυασμούς πολυμορφισμών ως ενιαίο παράγοντα κινδύνου εμφάνισης εμφράγματος του μυοκαρδίου.